Le meneur de FP3 Quartararo a donné le coup d’envoi avec un 1m37.064s, qui a été immédiatement battu par Marquez avec un 1m37.006s.
Le pilote Petronas Yamaha a plongé sous la barrière des 1m37s lors de son deuxième tour volant pour récupérer la pole provisoire avec un 1m36.993s, tandis que Francesco Bagnaia de Pramac a placé sa Ducati en troisième position malgré la rencontre d’un Valentino Rossi plus lent au dernier virage.
Marquez est revenu à la première place avec un. 1m36.877s sur son premier tour de sa deuxième manche, bien que cela ait été battu par Maverick Vinales, qui a mis dans un secteur final aveuglant pour finir avec un 1m36.844s.
Avec environ une minute à faire, Jack Miller de Pramac était dans un tour difficile pour la pole, mais a subi un crash rapide au virage 11.
Quelques secondes plus tard, Alex Rins s’est écrasé au même endroit et a dû être aidé à l’arrière d’une ambulance alors qu’il tenait son poignet.
Au milieu du drame, Quartararo a produit une 1m36.705s pour plonger sous le record du tour qu’il a établi en FP3 et assurer sa deuxième pole successive à Jerez.
Vinales s’est accroché à la deuxième place, Marquez complétant la première ligne devant Bagnaia – dont la quatrième place est le meilleur résultat de qualification de sa carrière.
Miller débutera aux côtés malgré sa chute en cinquième position, avec Cal Crutchlow de LCR à 0,001 derrière lui en sixième.
Pol Espargaro est arrivé en Q1 aux côtés de Rins et a placé sa KTM septième devant la Ducati d’usine d’Andrea Dovizioso, qui est tombée tard au virage 2.
Rins a terminé neuvième, bien que son départ semble désormais incertain, tandis que Franco Morbidelli (SRT), Rossi et Joan Mir (Suzuki) complètent le top 12.
Brad Binder a brièvement détenu le meilleur temps en Q1, et s’est finalement qualifié pour un impressionnant 13e pour ses débuts en MotoGP sur la KTM, n’ayant raté une place en Q2 que par 0,138s.
Le champion du monde Moto3 2016 a battu la Ducati d’origine de Danilo Petrucci, Takaaki Nakagami se classant 15e sur sa Honda LCR âgée d’un an.
Aleix Espargaro a été le meilleur Aprilia en 16e position, tandis que son coéquipier Bradley Smith a terminé 18e après avoir subi un accident de haut niveau au virage 2 dans les phases finales.
Johann Zarco a également subi une chute tardive, qui a empêché le pilote Avintia Ducati d’avancer sur sa 20e position devant le rookie Honda Alex Marquez et le Tech3 KTM d’Iker Lecuona.
